На основе анализа 37 аллозимных локусов проведена оценка генетической изменчивости и степени дифференциации популяций европейского хариуса из восточной части ареала (бассейны Баренцева и Белого морей). Генетические различия (DN=0,001–0,002) обнаружены даже между хариусами, обитающими в разных нерестовых притоках в пределах одной речной системы. Наиболее дифференцированы от остальных оказались популяции из рек Печоры и Индиги – водоемов, наиболее близких к Уральскому водоразделу. На основании величины выявленных различий (DN=0,035) и особенностей распределения изменчивости по отдельным аллозимным локусам рассматривается правомочность выделения хариусов, обитающих в водоемах Уральского региона, в качестве самостоятельной генетической линии, обособленной в течение продолжительного периода времени. Обсуждаются возможные источники постледниковой реколонизации хариусом водоемов северной части Европы.