В природном парке «Кожозерский» выявлено 151 вид листостебельных мхов из 74 родов и 31 семейства. Из них, 9 видов являются новыми для Архангельской области и 24 вида впервые обнаружены в Южном флористическом районе региона. Для флоры мхов парка характерно присутствие некоторых западных видов (Heterocladium dimorphum, Isothecium alopecuroides, I. myosuroides, Sphagnum quinquefarium), которые в восточных частях области не отмечены или очень редки. На его территории произрастает 22 редких мха. Один из них, Neckera pennata, занесен в Красную книгу Восточной Фенноскандии.