За исключением нескольких областей озеро Мичиган (ОМ) является олиготрофным водоемом с чистой и прозрачной водой. Вследствие воздействия` природных и антропогенных процессов, происходящих на водосборной территории, экологически наиболее серьезные процессы разворачиваются прежде всего в литоральной зоне. В мелководной ее части оптическое влияние дна на сигнал, регистрируемый спутниковым датчиком, оказывается достаточно сильным, что затрудняет дистанционное зондирование параметров качества воды в этих районах. Разработанный для оперативного восстановления параметров качества воды в оптически мелких водах новый био-оптический алгоритм основан на модели переноса излучения, модели оптических свойств вод ОМ и методе многомерной оптимизации. Применение разработанного алгоритма для обработки данных MODIS-Aqua убедительно показало преимущество нового алгоритма по сравнению со стандартным алгоритмом ОС4 в случае оптически мелких вод.