Одной из причин потепления климата, наблюдаемого в последние десятилетия, является увеличение в атмосфере концентрации парниковых газов. Среди них ведущая роль принадлежит СО2, посредством которого осуществляется перенос углерода между различными резервуарами планеты (литосфера, биосфера, атмосфера, гидросфера). Наземные водные экосистемы одновременно являются приемниками, преобразователями, накопителями и экспортерами терригенного и атмосферного углерода. Оценить аккумулирующую способность озера по отношению к углероду и ее изменения на разных этапах развития экосистемы водоема можно на основе изучения кернов донных отложений. В статье представлены результаты исследования донных отложений озера Чудесная ламба (заповедник «Кивач») и выявлены особенности накопления Cорг. По результатам литологического, гранулометрического и геохимического состава образцов были выделеным три горизонта в разрезе донных отложений, которые свидетельствуют о последовательной смене седиментационных обстановок в истории озера, произошедших при изменении климата и накоплении минерагенного, органо-минерагенного и органогенного осадочного вещества. Горизонт I (7,50–7,33 м) представлен донными отложениями, накопленными в и период Онежского приледникового озера, они имеют минеральный характер. Горизонт II (7,33–7,26 м) – осадки, формировавшиеся в период климатических изменений после изоляции озера от Онежского ьприледникового озера, отличаются значительным градиентом концентраций органического вещества. Горизонт III (7,26–7,10 м) формировался в голоцене, в это время водоем становится накопителем органического вещества. Полученная информация о содержании и особенностях накопления органического вещества в донных отложениях озера Чудесная ламба вместе с использованием балансовой модели потоков органического вещества в трофических сетях позволят рассчитать баланс углерода в экосистеме модельного водоема и разработать прогнозные оценки потоков СО₂ с поверхности воды в зависимости от химического состава воды и географического положения водоема.