По результатам 40-летних исследований подготовлен и издан атлас Онежского озера, включающий более 100 карт и схем по геологии, истории развития котловины, физической географии, гидрологии и климату, гидрофизике, гидрохимии и донным отложениям, гидробиологии, водному хозяйству, природным и культурно-историческим памятникам. Даны рекомендации по рациональному использованию и охране ресурсов озера
(лаборатория гидрохимии и гидрогеологии, лаборатория управления ресурсами водных объектов, лаборатория гидробиологии, лаборатория гидрофизики, лаборатория географии и гидрологии).
Впервые разработана и опубликована обобщающая сводка по альгофлоре водных экосистем Карелии, включающая систематический каталог (1092 таксона) и эколого-географические характеристики современных представителей водорослей 190 озер и 83 рек Карелии, как чистых (не затронутых хозяйственной деятельностью), так и подверженных основным типам антропогенного воздействия (лаборатория гидробиологии ИВПС, лаборатория экологии рыб и водных безпозвоночных ИБ).
Впервые по результатам многолетних исследований разнотипных озер Северо-Запада России установлены закономерности трансформации лабильных веществ, позволяющие прогнозировать изменения режима озер под влиянием антропогенных факторов. Установлена связь между удерживающей способностью и водообменом озер и выявлено, что удельная скорость трансформации вещества в озере на единицу внешней нагрузки остается постоянной для озер с одинаковым водообменом (лаборатория гидрохимии и гидрогеологии).